当内部控制缺陷的可能性为中等且影响程度为重大时，应归类为：

重大缺陷需同时满足可能性高和影响重大的条件，而重要缺陷是可能性和影响程度均处于中等或其中之一较高但未达重大标准的情形。选项B正确，其余选项不符合分类标准。