注册会计师在应对财务报表层次重大错报风险时，可能采取的措施有：

教材明确指出总体应对措施包括强调职业怀疑（对应A）、指派更有经验人员（对应D）、提供更多督导（对应B）、融入不可预见因素（对应A）。选项E属于认定层次的具体应对措施，选项C是审计程序的常规要求，不特定针对财务报表层次风险。